《第二代测序信息处理》几乎涵盖了NGS 技术在生命科学领域的全部应用，包括从头测序（含基因组注释）、针对稀有变异检测和元基因组研究的扩增子测序、染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）、RNA 测序（RNA-seq）和肿瘤体细胞变异检测（包括单碱基替换、插入、缺失和易位）等。通过广泛使用的一线软件充分讨论数据分析方法，详述最优工作流程（包括部分学习指南），实用性强、可靠性强、专业指导性强。
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《第二代测序信息处理》以30 多个美国国立卫生研究院资助项目的大量经验为基础，综合本领域著作并去粗取精，为读者提供了多种NGS 研究的全景展示，通过广泛使用的软件讨论数据分析方法，详述最优工作流程（包括部分学习指南）。
目录
1 DNA测序简介 Stuart M.Brovvn 1
2 测序信息学的历史 Stuart M.Brovvn 21
3 第二代测序数据的可视化 Phillip Ross Smith，Kranti Konganti 和Stuart M.Brown 34
4 DNA序列比对 Efstratios Efstathiadis 48
5 用广义de Bruijn 有向固算法组装基因组 D.Frank Hsu 62
6 用短序列读段从头组装细菌基因组 Silvia Argimon 和Stuart M.Brown 73
7 基因组注释 Steven Shen 84
8 使用第二代测序技术检测序列变异 Jinhua Wang Zuojian Tang和Stuart M Brown 96
9 ChIP-seq Zuojian Tang Christina Schwem，D.Frank Hsu 和Stuart M.Brown 104
10 使用第二代测序进行RNA 测序 Stuart M.Brown Jeremy Goecks 和James Taylor 129
11 元基因组学 Alexander Alekseyenko 和Stuart M.Brown 143
12 DNA测序信息学中的高性能计算 Efstratios Efstathiadis 和Eric R.Peskin 149
术语表 165
索引 174
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