卓新平的研究领域包括：宗教理论、基督教神学。出版个人学术专著12部、主编及合著10余部，发表论文80余篇。代表著有《宗教起源纵横谈》、《宗教与文化》、《尼布尔》、《世界宗教与宗教学》、《当代西方新教神学》、《当代西方天主教神学》、《宗教理解》、《基督宗教论》、《基督宗教研究》、《圣经鉴赏》等。《以文会友：序文集》为其序文集，收录了《雷立柏著<圣经思想漫画集>序》、《<圣经文化导论>序言》、等作品。
自序
一友人书序
1．《论基督之大与小》序
2．《张衡，科学与宗教》序
3．《基督教在中古欧洲的贡献》序
4．《记忆与光照》序
5．《圣经的语言和思想》编 者序
6．《古希腊罗马与基督宗教》序
7．《早期基督教的演变及多元传统》序
8．《中国教会大学史研究反思》序
9．雷立柏著《圣经思想漫画集》序
10．《“好消息”里的“更新”》序
11．《陶行知——一位基督徒教育家的再发现》序
12．《耶儒对话与融合》序
13．《希腊哲学的Being和早期基督教的上帝观》序
14．《文化正当性的冲突》序
15．《池田大作的佛学思想》序
16．《赵紫宸神学思想研究》序言
17．《谢扶雅的宗教思想》序
18．《从“神圣”到“努秘”》序
19．《公共神学与全球化：斯塔克豪思的基督教伦理研究》序
20．《汉语学术神学》序
21．《皈信·同化·叠合身份认同》序
22．《宗教与哲学》序
23．《诗人的神学——柯勒律治的浪漫主义思想》序
24．《徐梵澄传》序
25．《美国传教士与19世纪的中美外交关系（1830—1899）》序
26．《圣经文化导论》序言
27．《信仰但不认同——当代中国信仰的社会学诠释》序
二文集前言
1．《中国基督教基础知识》前言
2．《现阶段我国民族与宗教问题研究》前言
3．《相遇与对话》前言
4．《基督宗教与当代社会》前言
5．《宗教研究四十年》代前言：20世纪的中国宗教学发展
6．《信仰之间的重要相遇》序
7．《基督教文化160问》前言
8．《宗教对话与和谐社会》代序：和谐之音，始于对话
9．《当代中国宗教学术研究精选丛书·基督教卷》序言
10．《中国宗教学30年》序言
11．《水穷云起集》序
12．《基督宗教社会学说及社会责任》序
13．《20世纪中国社会科学·宗教学卷》序
14．《共建和谐：科学、宗教与发展论坛文集》序
15．《宗教对话与中国传统文化》序
三译著序言
1．《超越东西方》序
2．《基督宗教伦理学》中译本序
3．《日本神学史》中译本序
4．《基督教导论》中译本序
5．《耶稣会简史》序
6．《利玛窦中国书札》序
7．《基督宗教社会学说》汉译本序
8．《洗礼圣事·坚振圣事》中译本序言
9．“剑桥圣经注疏集”出版前言
四丛书前言
1．《基督宗教研究》（第一辑）前言
2．《基督宗教研究》（第二辑）前言
3．《基督宗教研究》（第三辑）前言
4．《基督宗教研究》（第四辑）前言
5．《基督宗教研究》（第五辑）前言
6．《基督宗教研究》（第六辑）前言
7．《基督宗教研究》（第七辑）前言
8．《基督宗教研究》（第八辑）前言
9．《基督宗教研究》（第九辑）前言
10．《基督宗教研究》（第十辑）前言
11．《基督宗教研究》（第十一辑）前言
12．《基督宗教研究》（第十二辑）前言
13．《宗教比较与对话》前言
14．“宗教与思想丛书”总序
15．“基督教文化丛书”总序
16．“宗教研究辞典丛书”总序
17．“当代基督宗教研究”丛书总序
18．“当代基督宗教译丛”总序
19．《中国宗教学》（第一辑）代前言：开创21世纪中国宗教学的新局面
20．《中国宗教学》（第二辑）前言
21．“基督宗教译丛”总序
22．“世界宗教研究译丛”总序
23．“基督宗教与公共价值”丛书总序
24．“世界宗教研究丛书”总序
25．“学术神学”丛书总序
五导言导读
1．《中国五大宗教知识读本》前言
2．《纪念任继愈所长文集》序
3．《基督教与中国文化》导读
附一卓新平学术简历
附二卓新平主要著述目录
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