生命是一个复杂的过程,有很多的例外情况,许多最关键的现象往往不能用已有理论来解释。表观遗传学正是在这些例外的基础之上发展成型的。这些非DNA变化但可继承的现象与癌、衰老、动植物发育等热点问题密切相关,受到广泛关注。本书是表观遗传学领域领军人物的扛鼎之作,是该领域第一本系统性、权威性论著,不仅涉及一线研究的方方面面,还用专门章节讲述了表观遗传学的发展历程。通过本书,读者可以对这门新兴热点学科由一个深入而完整的认识。
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《表观遗传学》是许多才华横溢的同事们的创作结晶,他们的共同努力使本书得以成稿并让这个编撰过程成为一个富有意义的人生经历。编者们毫不犹豫地向远在伦敦的Marie-Laure Caparros女士致以最高的谢意,没有她的帮助,本书不可能得以最终出版。在本书编撰过程的早期,编者们认识到需要有人协调这一庞大的工作。尤其是需要有专人与40多名作者保持沟通、反馈意见,并让作者们认识到我们需要的不仅仅是他们的专业论述和细致工作。Marie-Laure激励着大家保持创作的动力,勇敢地提出必要的批评意见,提醒着大家保持进度,维持着工作的一致性,使得各章节从雏形发展成终稿。没有她,本书将不可能变为现实。我们也对各自的助手表示感谢,他们是:Elizabeth Conley(David Allis)、Christopher Robinson(Thomas Jenuwein) 和Shelli Altman(Danny Reinberg),是他们使我们的工作井井有条,他们是本书的幕后英雄。我们对他们大大小小、不计其数的贡献表示感谢;也感谢他们对我们每个人古怪的工作方式和作为编者的各种缺点所抱有的无尽的耐心。
2004年夏天,在成功的第69届冷泉港“表观遗传学”会议的鸡尾酒会上我们完成了本书雏形的讨论。本书是由冷泉港实验室出版社通过Alex Gann等同事在2003年初委托撰写的,由David Allis、Thomas Jenuwein和Danny Reinberg组织了编者队伍。本书最初的轮廓,包括章节与作者的选择,形成于2003年6月在美国科罗拉多州Snowmass召开的FASEB“染色质与转录”会议的野餐会上。此后我们非常幸运地获得了各领域学术带头专家撰写各个章节的承诺。
在早期策划阶段,我们产生了一个新的思路。我们的每一章节均邀请两位专家撰写,试图为染色质生物学的学生和其他领域的同事提供一整套概述性的介绍,突出那些重要的发现,而非堆砌一些可能很快就会过时的综述。我们希望本书能通过保持一个概述性的框架,而拥有更长久的影响力。此外,通过加入大量的图表和附录,我们希望能尽可能多地列出已知的研究系统和表观遗传标志。每一章前都有一个对本章进行概括的独立成文的摘要,章前也设置了相关图片以吸引读者阅读。
本书的另一重要特点是插图,第3章尤具代表性。Marie-Laure Caparros和Jenuweln实验室(IMP,维也纳)的博士生Stefan Kubicek是创作这些图表的大师。他们对各章节中的图,有些甚至从草图开始,进行了一稿又一稿的润饰,让我们能获得更为一致的表述。来自各个作者实验室的数位博士后和博士生(Gabriella Farkas、Fatima Santos、Heike Wohrmann等)也为本书贡献了出色的图片。然而,我们并未能将所有图表加以修改。我们还要特别感谢Allis、Jenuwein和Reinberg实验室的Monika Lachner、Mario Richter、Roopsha Sengupta、Patrick Trojer等博士生和博士后对附录表格和摘要的修改、校对和定稿。Steven Gray博士(St.James医院,都柏林)对确认及补充目前所有已知组蛋白修饰的列表给予了极大的帮助。
目录
译者序
前言
第1章 表现遗传学:从现象到领域 1
第2章 表观遗传学发展简史 17
第3章 概述与概念 27
第4章 酿酒酵母的表现遗传学 75
第5章 果蝇位置效应花斑、异染色质形成和基因沉默 97
第6章 表观遗传学研究的真菌模型:裂殖酵母和链拖霉 121
第7章 纤毛动物的表现遗传学 151
第8章 RNAi 和异染色质组装 179
第9章 植物的表现遗传调控 199
第10章 染色质修饰及其作用机理 227
第11章 Polycomb 蛋白家族调控的转录沉默 251
第12章 三胸蛋白家族(trxG)与转录调控 275
第13章 组蛋白变体和表观遗传学 295
第14章 染色体遣传的表观遗传学调控 315
第IS章 秀丽隐杆线虫X 染色体的表现遗传学调控 345
第16章 果蝇申的剂量补偿效应 363
第17章 哺乳动物申的剂量补偿效应 379
第18章 哺乳动物的DNA 甲基化 405
第19章 晴乳动物基因组印记 423
第20章 生殖细胞系和多能干细胞 445
第21章 淋巴细胞生成的表现遗传学调控 467
第22章 核移植和基因组重编程 489
第23章 表现遗传学和人类疾病 513
第24章 癌症的表观遗传决定因素 539
附录A 网络资源 561
附录B 组蛋白修饰 563
附录C 不同模式生物中的表观遗传机制 570
附录D 组蛋白修饰的Brno命名法 571
索引 572